Ómicron: ¿Qué sabemos de las nuevas versiones BA.2.12.1 y BA.2.12.2?
Se publicó en CNN Health, el 19 de abril, Nuevas versiones de Ómicron avanzan sobre BA.2, una nota de actualidad con datos del CDC de los Estados Unidos, también comentador por Eric Topol en un Twitter.
Aumento del riesgo de reinfección por SARS-CoV-2 asociado a Ómicron
La variante Ómicron presenta un riesgo de reinfección casi 3 veces mayor que las variantes Delta y Beta, las cepas actualmente dominantes en Sudáfrica.
En un análisis de los datos de vigilancia epidemiológica de rutina de Sudáfrica, se demostró a nivel poblacional, la capacidad de la variante Ómicron de evadir la respuesta inmune de una infección previa.
Esta es una pre-publicación, a la espera de revisión por pares (es decir , por otros profesionales que analicen la base de datos, la veracidad de éstos y la precisión de los análisis estadísticos), y por el diseño probablemente se haya presentado en The Lancet para su publicación definitiva.
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¿De dónde vino la extraña variante Ómicron?
Al parecer, Ómicron no se originó de las variantes anteriores, como Alfa o Delta. Parece haber evolucionado en paralelo a estás.
Dan 3 posibles explicaciones:
– Circulación del virus en una población con poca vigilancia y secuenciación genómica.
– Un paciente con infección crónica por Covid-19.
– Algunos piensan que el virus puede haberse escondido en roedores y otros animales, en lugar de personas, y de ahí infectar nuevamente a los humanos.
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Variante Ómicron ¿Qué sabemos hasta hoy?
Ómicron es la variante del SARS-CoV-2 que acumula más mutaciones hasta ahora.
Tiene cambios ya vistos en otras VOC, que pueden aportar mayor transmisibilidad, y otros que pueden aportar resistencia parcial a vacunas. Tiene además mutaciones no vistas en ninguna otra variante.
En total acumula 50 mutaciones, 30 de ellas en la proteína S, que es el objetivo principal de las vacunas.
Una de las mutaciones hace que el gen S, uno de los objetivos de la PCR, no sea detectado, dando un resultado “falso negativo” para este gen, lo que puede ser una característica diagnóstica, ante falta de pruebas de secuenciación, en regiones dónde antes predominó Delta.
Se están llevando a cabo ensayos de neutralización con anticuerpos, así como con células T. Estos estudios van a llevar semanas en completarse.
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Actualizaciones de Ómicron en todo el mundo
Por el momento, el nivel de evidencia del que disponemos es mayormente el de las opiniones de los expertos, y a partir de sitios de interés general, hasta que se genere con el paso de las semanas evidencia de mejor calidad.
En la opinión del Doctor Anthony Fauci, la autoridad en salud más respetada de los Estados Unidos, Ómicron inevitablemente se extenderá por todo el mundo, ya que cuenta al menor con las mutaciones necesarias para poder transmitirse más.
Pese a esto, los vacunados parecen tener mejor evolución que los no vacunados, y los que recibieron refuerzos, mejor aún.
Hasta ayer a la mañana, 12 países habían notificado casos de la nueva variante.
En el mundo aumentan las restricciones a los viajeros que vienen de África, incluso, algunos países fueron a un cierre total de fronteras, como Japón, Israel y Marruecos, en un esfuerzo para disminuir la velocidad de propagación de la nueva variante.
Reportan cada vez más infecciones irruptivas (aquellas que se dan en los completamente vacunados).
plantean aquí que la variante tiene una “mezcla de Frankenstein”, lo que le podría otorgar una mayor transmisibilidad y la capacidad de evadir la respuesta inmune aportada por la infección natural (suben los reportes de reinfecciones), tanto como por las vacunas (infecciones irruptivas).
Moderna y Pfizer están probando sus vacunas contra la nueva cepa. Afirman que pueden adaptar sus plataformas para generar vacunas dirigidas en 6-8 semanas.
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Omicron ¿La variante más peligrosa?
Una nueva variante del SARS-CoV-2, B1.1.529, Omicron o variante de Botswana, surgió en el sur de África, en la segunda semana de noviembre.
El 27 de noviembre fue nombrada por la OMS como una variante de preocupación (VOC, Variant of Concern).
Acumula al menor una 50 mutaciones, 32 de ellas en la proteína S o de pico, y 15 en el sitio RBD, responsable de la unión del virus a la célula huésped humana.
Comparte con las variantes Delta y Beta las mutaciones K417N y E384A, lo que le podría permitir evadir la respuesta inmune generada por las vacunas.
Tiene además las mutaciones N440K, presente en Delta, y S477N, presente en la variante de Nueva York, B.1.526, ambas relacionadas con el escape de anticuerpos.
Las mutaciones P681H h N689K también la podrían hacer resistentes a las vacunas.
Nueva variante del coronavirus: ¿Qué se sabe de la variante Omicron, B.1.1.529 o variante de Botswana?
África, al día de la fecha, cuenta con casi 9 millones de infecciones reportadas, y 222.000 muertes por coronavirus. En los últimos 10 días, las infecciones vienen aumentando día a día. Según los CDC africanos, el 9.52% de la población tiene al menos una dosis de vacuna, y el 6.48%, dos.
Se identificó por primera este mes en Botswana, y apareció en un viajero de 36 años que llegó a Hong Kong desde Sudáfrica en 13 de noviembre, una nueva variante del SARS-CoV-2, y que probablemente será etiquetada por la OMS como la cepa Nu, la letra que sigue en el alfabeto griego para nominar las variantes.
Actualmente es conocida como B.1.1.529. Acumula un gran número de mutaciones, 32 en total, centradas en la proteína S, incluídas las mutaciones propias de Delta.
Está proteína es la llave con que el SARS-CoV-2 ingresa a las células, y es el blanco de la respuesta inmune adquirida por vacunas o infección.
Se desconocen aún las propiedades de está variante, como por ejemplo capacidad de evadir la respuesta inmune generada por las vacunas o por la infección previa.
También resta saber que importancia tiene está cepa para extenderse mundialmente, y provocar nuevas olas de infecciones.
Se está investigando si produce una enfermedad más grave, o más leve.
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Evasión inmune por la variante de preocupación B.1.427/B.1.429 del SARS-CoV-2
La variante de preocupación B1.427/ B1.429 del SARS-CoV-2 (variante CAL.20C, Epsilon), originalmente detectada California, porta 3 mutaciones mayores en la proteína S: S13I en el péptido señal, W152C en el dominio N-terminal (NTD), y L452R en el dominio de unión al receptor (RBD). Estás la hacen más agresiva, ya que le permiten evadir al sistema inmune.B1.427 y B1.429 son 2 linajes en realidad, pertenecientes al clado 20C, que comparten las 3 mutaciones mayores antes enumeradas.
La prisa por estudiar las variantes del coronavirus de rápida diseminación
Se publicó el 3 de junio de este año en Nature La prisa por estudiar las variantes del coronavirus de rápida diseminación, un repaso sobre lo que sabemos de la variante B.1.617 del SARS-CoV-2, haciendo foco en los datos de transmisibilidad, virulencia y posibilidad de escape a las vacunas. La variante del SARS-CoV-2 B.1.617 (cepa India o Delta) se ha propagado a decenas de países, incluidos Estados Unidos, Singapur y Reino Unido, donde en algunas regiones se ha vuelto dominante.
Interacción entre las variantes emergentes del SARS-CoV-2 y el control de la pandemia
Los principales determinantes de la aparición de mutaciones del #SARSCoV2 son la transmisión continua y la replicación sin control del #virus. Limitar la transmisión viral mediante el uso generalizado de vacunas, enmascaramiento facial, #distanciamiento social y otras medidas de prevención reducirá la aparición de las mutaciones virales. El 5 de mayo se publicó en NEJM una nota Editorial, Interacción entre las variantes emergentes del SARS-CoV-2 y el control de la pandemia, basada en 2 ensayos revisados por pares, que evalúan la eficacia de 2 vacunas contra la variante de Sudáfrica, probadas en un momento de alta circulación de la misma.