PODCAST | Ómicron: origen y características de una variante que preocupa. La opinión de un experto.

El reconocimiento reciente de una nueva variante del SARS-CoV-2 en Sudáfrica motivó que los editores del New England Journal of Medicine entrevistaran al Dr. Salim Abdool Karim, reconocido epidemiólogo e infectólogo residente en Durban (Sudáfrica).
La variante Ómicron presenta mutaciones ya previamente presentes en otras variantes (Alfa, Beta, Gamma y Delta) con el potencial de conferir el potencial de evadir la respuesta inmune en individuos que ya sufrieron COVID-19 o estaban previamente vacunados, y con el potencial de aumentar la transmisibilidad, y también presenta mutaciones nuevas cuya significación aun no es conocida.
Se ha identificado un número significativo de reinfecciones en Sudáfrica, en relación con la aparición de esta nueva variante. Sin embargo, no se ha observado a la fecha un impacto correlativo de similar envergadura en el número de internaciones o muertes por COVID-19.
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Aumento del riesgo de reinfección por SARS-CoV-2 asociado a Ómicron

La variante Ómicron presenta un riesgo de reinfección casi 3 veces mayor que las variantes Delta y Beta, las cepas actualmente dominantes en Sudáfrica.
En un análisis de los datos de vigilancia epidemiológica de rutina de Sudáfrica, se demostró a nivel poblacional, la capacidad de la variante Ómicron de evadir la respuesta inmune de una infección previa.
Esta es una pre-publicación, a la espera de revisión por pares (es decir , por otros profesionales que analicen la base de datos, la veracidad de éstos y la precisión de los análisis estadísticos), y por el diseño probablemente se haya presentado en The Lancet para su publicación definitiva.
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¿De dónde vino la extraña variante Ómicron?

Al parecer, Ómicron no se originó de las variantes anteriores, como Alfa o Delta. Parece haber evolucionado en paralelo a estás.
Dan 3 posibles explicaciones:
– Circulación del virus en una población con poca vigilancia y secuenciación genómica.
– Un paciente con infección crónica por Covid-19.
– Algunos piensan que el virus puede haberse escondido en roedores y otros animales, en lugar de personas, y de ahí infectar nuevamente a los humanos.
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Variante Ómicron ¿Qué sabemos hasta hoy?

Ómicron es la variante del SARS-CoV-2 que acumula más mutaciones hasta ahora.
Tiene cambios ya vistos en otras VOC, que pueden aportar mayor transmisibilidad, y otros que pueden aportar resistencia parcial a vacunas. Tiene además mutaciones no vistas en ninguna otra variante.
En total acumula 50 mutaciones, 30 de ellas en la proteína S, que es el objetivo principal de las vacunas.
Una de las mutaciones hace que el gen S, uno de los objetivos de la PCR, no sea detectado, dando un resultado “falso negativo” para este gen, lo que puede ser una característica diagnóstica, ante falta de pruebas de secuenciación, en regiones dónde antes predominó Delta.
Se están llevando a cabo ensayos de neutralización con anticuerpos, así como con células T. Estos estudios van a llevar semanas en completarse.
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Actualizaciones de Ómicron en todo el mundo

Por el momento, el nivel de evidencia del que disponemos es mayormente el de las opiniones de los expertos, y a partir de sitios de interés general, hasta que se genere con el paso de las semanas evidencia de mejor calidad.
En la opinión del Doctor Anthony Fauci, la autoridad en salud más respetada de los Estados Unidos, Ómicron inevitablemente se extenderá por todo el mundo, ya que cuenta al menor con las mutaciones necesarias para poder transmitirse más.
Pese a esto, los vacunados parecen tener mejor evolución que los no vacunados, y los que recibieron refuerzos, mejor aún.
Hasta ayer a la mañana, 12 países habían notificado casos de la nueva variante.
En el mundo aumentan las restricciones a los viajeros que vienen de África, incluso, algunos países fueron a un cierre total de fronteras, como Japón, Israel y Marruecos, en un esfuerzo para disminuir la velocidad de propagación de la nueva variante.
Reportan cada vez más infecciones irruptivas (aquellas que se dan en los completamente vacunados).
plantean aquí que la variante tiene una “mezcla de Frankenstein”, lo que le podría otorgar una mayor transmisibilidad y la capacidad de evadir la respuesta inmune aportada por la infección natural (suben los reportes de reinfecciones), tanto como por las vacunas (infecciones irruptivas).
Moderna y Pfizer están probando sus vacunas contra la nueva cepa. Afirman que pueden adaptar sus plataformas para generar vacunas dirigidas en 6-8 semanas.
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Omicron ¿La variante más peligrosa?

Una nueva variante del SARS-CoV-2, B1.1.529, Omicron o variante de Botswana, surgió en el sur de África, en la segunda semana de noviembre.
El 27 de noviembre fue nombrada por la OMS como una variante de preocupación (VOC, Variant of Concern).
Acumula al menor una 50 mutaciones, 32 de ellas en la proteína S o de pico, y 15 en el sitio RBD, responsable de la unión del virus a la célula huésped humana.
Comparte con las variantes Delta y Beta las mutaciones K417N y E384A, lo que le podría permitir evadir la respuesta inmune generada por las vacunas.
Tiene además las mutaciones N440K, presente en Delta, y S477N, presente en la variante de Nueva York, B.1.526, ambas relacionadas con el escape de anticuerpos.
Las mutaciones P681H h N689K también la podrían hacer resistentes a las vacunas.